Las disposiciones de la Ley Federal de Derechos del Contribuyente son aplicables a todos los actos de las autoridades fiscales en general, y no únicamente a aquellos derivados del ejercicio de las facultades de comprobación iniciadas a partir de su entrada en vigor.

El artículo segundo transitorio de la Ley Federal de Derechos del Contribuyente establece que sus disposiciones solo se aplicarán al ejercicio de las facultades de comprobación iniciadas a partir de su entrada en vigor. Sin embargo, esta limitación no restringe la aplicabilidad de la ley a todos los actos de las autoridades fiscales, ya que su objetivo principal es regular los derechos y garantías fundamentales de los contribuyentes en sus interacciones con dichas autoridades.