El incumplimiento de las sentencias de amparo se actualiza cuando las autoridades responsables, pretextando la necesidad de realizar procedimientos innecesarios para cumplir el fallo, retrasan injustificadamente su ejecución, lo que puede dar lugar a la separación de los funcionarios y su consignación penal.

El Pleno de la Suprema Corte de Justicia de la Nación establece que el incumplimiento de una sentencia de amparo se configura cuando las autoridades responsables, bajo el pretexto de realizar trámites, dilatan injustificadamente la ejecución del fallo. En tales casos, la Corte puede separar a los funcionarios responsables y a sus superiores jerárquicos, consignándolos ante el juez penal competente por el delito de incumplimiento de sentencia. Posteriormente, se devuelven los autos al tribunal de amparo para que continúe el trámite de cumplimiento con los nuevos titulares.