La autonomía municipal se transgrede cuando el Poder Ejecutivo Federal omite la entrega de recursos federales aprobados para programas de infraestructura, sin demostrar la improcedencia legal de dicha omisión o la existencia de causas de fuerza mayor que la justifiquen.

La Primera Sala de la Suprema Corte de Justicia de la Nación resolvió una controversia constitucional promovida por el Municipio de Ilamatlán, Veracruz, en contra del Poder Ejecutivo Federal por la omisión de entregar la cantidad de $1'737,426.00 correspondientes a subsidios federales para infraestructura de vivienda. La Sala determinó que el Municipio acreditó la aprobación de los fondos y la ejecución de las obras, mientras que el Ejecutivo Federal no demostró la falta de disponibilidad presupuestaria como causa justificada para la retención. Por lo tanto, se consideró vulnerada la autonomía municipal y se condenó al Ejecutivo Federal a la entrega de los recursos y los intereses correspondientes.